Op 1 januari 2014 werd Agentschap Plantentuin Meise opgericht als extern verzelfstandigd agentschap van de Vlaamse Overheid. Agentschap Plantentuin Meise is bijgevolg gebonden aan de voorwaarden gesteld in het Vlaamse Codex Overheidsfinanciën (VCO) van 29 maart 2019 en die toepasselijk is vanaf 1 januari 2020.
Het VCO voorziet in een bedrijfseconomische en een budgettaire boekhouding, alsook een volledige jaarrapportering, waarbij zowel de bedrijfseconomische als de budgettaire rapportering opgenomen zijn.
Volgens het financiële verslag boekte de Plantentuin vorig jaar een negatief resultaat (verlies) van 2,3 miljoen euro. Daar heeft de coronacrisis uiteraard veel mee te maken.
